Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms