Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin3Q9JLB9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms