Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc5a3Q9JKZ2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms