Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms