Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms