Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Obox1Q9D350 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Obox1Q9D350 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Obox1Q9D350 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Obox1Q9D350 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Obox1Q9D350 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Obox1Q9D350 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Obox1Q9D350 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Obox1Q9D350 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Obox1Q9D350 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Obox1Q9D350 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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