Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpb2Q9CQI7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms