Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Chmp3Q9CQ10 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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