Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS0

Pglyrp2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp2Q8VCS0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pglyrp2Q8VCS0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pglyrp2Q8VCS0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pglyrp2Q8VCS0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pglyrp2Q8VCS0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pglyrp2Q8VCS0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pglyrp2Q8VCS0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pglyrp2Q8VCS0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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