Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNBD1Q8NA66 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms