Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH66

Atl1, Atlastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl1Q8BH66 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl1Q8BH66 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms