Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Bnip1Q6QD59 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Bnip1Q6QD59 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Bnip1Q6QD59 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Bnip1Q6QD59 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Bnip1Q6QD59 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Bnip1Q6QD59 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Bnip1Q6QD59 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bnip1Q6QD59 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Bnip1Q6QD59 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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