Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp1Q62442 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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