Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HnrnpdQ60668 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms