Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB2Q5VUJ9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms