Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms