Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otol1Q4ZJM7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otol1Q4ZJM7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms