Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr41Q3UDP0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms