Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc136Q3TVA9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc136Q3TVA9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms