Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl9Q32KG4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms