Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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