Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rundc1Q0VDN7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc1Q0VDN7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms