Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GscQ02591 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GscQ02591 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GscQ02591 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GscQ02591 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GscQ02591 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms