Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx3P81067 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx3P81067 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx3P81067 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx3P81067 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Irx3P81067 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx3P81067 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms