Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx3P70354 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msx3P70354 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms