Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp1P55194 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms