Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxrgP28705 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxrgP28705 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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