Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms