Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ARID3CA6NKF2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID3CA6NKF2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms