Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms