Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRP68Q9UHB9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP68Q9UHB9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms