Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC4BQ9NT99 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms