Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndst3Q9EQH7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms