Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms