Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Ifitm3Q9CQW9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ifitm3Q9CQW9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms