Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN1

Trap1, Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trap1Q9CQN1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trap1Q9CQN1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms