Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Pdzk1ip1Q9CQH0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Pdzk1ip1Q9CQH0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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