Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim8Q99PJ2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms