Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ophn1Q99J31 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms