Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc49Q91YK0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms