Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms