Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hpf1Q8CFE2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms