Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB27

Yod1, Ubiquitin thioesterase OTU1, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yod1Q8CB27 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Yod1Q8CB27 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Yod1Q8CB27 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Yod1Q8CB27 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Yod1Q8CB27 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Yod1Q8CB27 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Yod1Q8CB27 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Yod1Q8CB27 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Yod1Q8CB27 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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