Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms