Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms