Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cachd1Q6PDJ1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms