Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms