Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms