Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim24Q64127 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim24Q64127 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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