Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ttf1Q62187 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ttf1Q62187 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ttf1Q62187 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ttf1Q62187 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttf1Q62187 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms